Guitar Hero II cuenta con los siguientes modos de juego:
- Carrera: Consistente en formar una banda e ir tocando en diferentes lugares ganando dinero con el que podrás comprar nuevos personajes, guitarras, acabados, nuevos temas y videos extra. Según vas avanzando, se van desbloqueando nuevos escenarios y nuevos grupos de canciones. El modo Carrera puede ser jugado en 4 dificultades (fácil, medio, difícil y experto). En total, una vez desbloqueadas todas las canciones, la lista asciende a más de 70, sin contar las descargadas por Xbox Live.
- Partida rápida: En este modo podrás tocar cualquiera de las canciones desbloqueadas en el modo carrera, eligiendo el guitarrista, la guitarra, la canción y la dificultad que quieras. - Duelo de Guitarras (Multijugador): Dos jugadores se enfrentan cara a cara alternándose el cuadro de notas, pudiendo elegir cada uno una dificultad diferente ademada a su pericia con el traste.

- Cooperativo (Multijugador): En este modo los dos jugadores tocan la canción a la vez, pero uno de ellos toca el bajo, complementando así a la guitarra solista. - Duelo de Guitarras Pro (Multijugador): Es igual al duelo de guitarras normal salvo que ahora los dos tocan la canción entera a la vez en vez de ir alternándose, como sucede en el “Duelo de guitarras”.
- Ensayo: Aquí podrás practicar aquellas canciones que se te atraviesan y que quieres mejorar, pudiendo seleccionar una parte concreta de la canción y modificar la velocidad de la misma para facilitar así su realización, e ir mejorando poco a poco. También este modo cuenta con un tutorial en el que se explica brevemente los principales conceptos y elementos del juego.