El juego nos narra toda la historia usando el propio motor, con las oportunas peleas de por medio. Disponemos de dos campañas diferentes, una por cada bando, pudiendo contemplar la trama desde dos puntos de vista diferentes. Sin duda alguna este modo Historia es el principal modo del juego, aunque presenta diversos modos complementarios, como son:

•    Modo Arcade > El clásico por excelencia de la saga. Consiste en derrotar a nuestros oponentes en una serie de combates predeterminados hasta llegar al jefe final. Podremos elegir si queremos luchar sólo contra personajes de Mortal Kombat, DC Universe o una mezcla de ambos.

•    Modo Kombat Kombo > Sirve para practicar los movimientos y combos de los personajes. Completando cada personaje nos darán puntos de logros.

•    Modo Versus > Modo clásico entre los clásicos. Uno contra uno, ninguna complicación más. Si tienes con quien jugar, te dará bastantes horas de diversión.

•    Modo Online > Uno de los más cuidados del juego. Para jugar es tan sencillo como unirnos a una de las salas disponibles (o crear una propia) y retar o ser retados por alguien. En cuestión de segundos estaremos partiéndonos la cara con cualquier jugador, que no dudará ni un segundo a la hora de destrozarnos combo tras combo para rematar la faena con un buen fatality. Estas salas, además, nos permiten echar un vistazo a todo tipo de estadísticas y tablas así como entablar conversaciones de texto (tipo chat de toda la vida) con el resto de jugadores.

Como en todo juego de lucha, algunos aspectos de los combates nos gustarán más que otros. En este, una de las principales novedades en la saga es la posibilidad de agarrar al adversario para dar pie a una especie de “pulso este botón y si el otro no lo acierta le arreo”. Obviamente si ambos luchadores coinciden en el golpe se acabó lo que se daba y recibe el atacante en primera instancia. Se convierte en una cuestión de suerte y recuerda, por ejemplo, a la ejecución de ciertos movimientos especiales en algunos títulos de la saga ‘Dragon Ball Z’. También el intercambio de un escenario a otro hace uso de esta técnica, dándole un toque de cómic a las escenas bastante bien recreado.